3 ans après avoir rétréci ses enfants, Wayne Szalinski a retrouvé un poste dans un laboratoire du Nevada, où il travaille sur un rayon de dilatation des molécules au Nième degré. Mais le projet lui est retiré. Frustré, il va expérimenté le rayon hez lui et, par mégardes, transforme accidentellement son petit dernier âgé de 2 ans, Adam, en un véritable godzilla en culottes courtes...