Après la mort de Robin et « l'opération Super Compile », Hyde (voulant venger Mary) ramène les fugitifs du Pays des Histoires Secrètes / l'Île mystérieuse : « l'Oracle » et son oiseau rouge, Edmond Dantès, Lady Trémaine, Clorinda, le capitaine Nemo, Liam Jones Jr. et Jasmine (fille du Sultan) qui retrouve Aladdin, le « Sauveur » déchu via les ciseaux des Moires. Durant « l'opération Cobra 2 », Emma a des visions de son futur assassin capuchonné et Belle, sortie du Pays des Rêves, accouche de Gideon / « Morphée » dont elle se sépare. Le double de Regina, la Méchante Reine, s'invite et influence Gold, Zelena et avec le marteau d'Héphaïstos, Henry. Elle enlève Archie, ensorcelle les Charmant puis piège Emma et Regina dans le Monde derrière le Miroir puis dans une uchronie sans « Sauveur » où Regina retrouve un Robin alternatif. Régina et Emma avaient trouvé un moyen de rentrer dans le monde réel grâce au Rumplestilskin alternatif mais l’arrivée du Robin de ce monde a troublé Regina. Elles retrouvent finalement Storybrooke grâce à Pinocchio avec Robin par une porte faite dans le même bois que l’armoire magique qui avait envoyé Emma dans le monde réel. De retour à Storybrooke, l'identité de l’homme à capuches destiné à tuer Emma est révélée : c'est Gideon, enlevé par la Fée noire et élevé comme son propre fils. Rumplestiltskin prend part au combat autant pour sauver son fils que pour affronter la Fée noire, sa mère.